Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms