Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-Eb2Q3UUV9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-Eb2Q3UUV9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Eb2Q3UUV9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Eb2Q3UUV9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Eb2Q3UUV9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-Eb2Q3UUV9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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