Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms