Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms