Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms