Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms