Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpr55Q3UJF0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms