Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms