Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms