Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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