Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms