Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.9 ms