Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Puf60Q3UEB3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms