Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms