Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cops9Q3U898 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cops9Q3U898 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cops9Q3U898 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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