Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms