Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U6N9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U6N9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U6N9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U6N9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U6N9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U6N9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U6N9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U6N9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3U6N9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms