Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U595 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U595 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U595 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U595 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U595 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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