Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U1D9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms