Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tatdn3Q3U1C6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tatdn3Q3U1C6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms