Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms