Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms