Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca4Q3TKT4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms