Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms