Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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