Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem248Q3TBN1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem248Q3TBN1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms