Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms