Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrriq1Q0P5X1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrriq1Q0P5X1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms