Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms