Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms