Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Ttc21bQ0HA38 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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Ttc21bQ0HA38 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Ttc21bQ0HA38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Ttc21bQ0HA38 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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