Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms