Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms