Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MestQ07646 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms