Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms