Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms