Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms