Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms