Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cacna1sQ02789 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1sQ02789 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms