Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GscQ02591 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GscQ02591 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms