Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms