Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2cQ01098 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms