Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin2bQ01097 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms