Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F8a1Q00558 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms