Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca2P97929 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Brca2P97929 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brca2P97929 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms