Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cry1P97784 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms