Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2cP97760 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms