Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms