Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms