Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkdcP97313 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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